据从台湾“农粮署副署长”消息，在日本地震引发海啸后，立即与出口贸易商及农民联系，台湾出口日本的花卉损失较为严重，包括东北地区6家花卉批发市场全毁，横滨港损坏无法按时通关领货，统计花卉受损515万支，金额估算约新台币9500万元。
台湾输往日本的花卉也受到冲击，台湾“农粮署”表示，日本东北地区6家花卉批发市场全毁，横滨港损坏，无法按时通关领货，造成台湾已出口切花受损，统计贸易商提供的受损资料，数量约515万支，金额达新台币9500万元，至于销日水果，只有菠萝暂缓出货。
台湾花卉贸易业者纷纷减少出货，甚至取消出口，“农粮署”将辅导出口商，寻找大陆、菲律宾及东南亚等国家和地区的市场，或由日本南部港口转运。此外，“农委会”与台湾红十字组织从3月19日到26日在花博会场圆山、新生、大佳河滨公园出口处，联合办理公益劝募活动。
在水果方面，预定销往福岛、仙台地区的菠萝暂缓出货，香蕉按原订规划期程出货，其余芒果、荔枝、葡萄、椪柑、木瓜、红龙果等目前不是产期，影响程度尚待观察；蔬菜部分，已有日商陆续前来洽询蔬菜出口事宜，预估出口量将增加。
